Disclaimer : ce n'est pas mon domaine mais j'ai dû m'y intéresser pour raisons professionnelles.
Il n'y a pas UNE SEULE bactérie E. coli mais pleins de sérotypes différents.
Dont certaines sont pathogènes, par exemple la célèbre O157:H7.
Ces souches sont souvent (?) désignées par l'acronyme STEC (Shiga-Toxin Producing E. Coli)
Ce n'est en général pas bon signe de retrouver E. coli en trop grande quantité sur une ligne de production agro-alimentaire ou dans des cuisines mais comme le souligne @leftascenter, il y en a partout où il y a des animaux puisque on la retrouve dans les systèmes digestifs des bovins et des humains notamment.
C'est la même histoire avec Salmonella qui vit dans les systèmes digestifs des volailles. Certaines souches sont pathogènes, mais pas toutes.
On peut très bien consommer un aliment « contaminé » par l'une de ces souches et ne pas tomber malade, ça dépend de plusieurs facteurs dont la quantité de bactéries ingérées (malheureusement peu élevée pour cet E. coli) et son état de santé (celui de la personne et de la bactérie :) ). Sans surprise, si votre système immunitaire n'est pas en forme vos chances de tomber malade augmentent. Sans surprise (bis), c'est plsu fréquemment le cas chez les personnes âgées ou immunodéprimées.
Bref, on ne va pas sortir « un vaccin contre E. coli » mais un vaccin qui va permettre d'immuniser (avec quelle probabilité ?) contre certains sérotypes d'E. coli responsables d'infections extra-intestinales.
Vacciné(e) ou pas, lavez-vous les mains en sortant des toilettes et respectez les bonnes pratiques d'hygiène quand vous cuisinez ! Gardez les produits à base de viande au frigo jusqu'à la dernière minute et cuisez-les bien. Ne coupez pas les légumes sur la planche ou avec le couteau qui a servi à préparer la viande, etc.
Voilà, je râle mais ce vaccin est quand même une bonne nouvelle qui, j'espère, sauvera des vies.
SI ça vous intéresse il y a pas mal de textes réglementaires qui décrivent quels aliments doivent être contrôlés pour la présence ou l'énumération d'E. coli et comment s'y prendre. Allez regarder les normes ISO 4831 ou ISO 4832. Pour les souches pathogènes, l'ISO/TS 13136 vous expliquera comment détecter les STEC.