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dominiksteiger

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Interested in politics and policy, science and health, the analogue going digital, and endemic delusion. Views my own. Maybe now indexed by tootfinder.

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Schätzung für Zürich aufgrund Kalibrierung der Abwasserprävalenzen Werdhölzli, Daten bis 19. Mai:

Inzidenz ~900.

Ca. jede 110. Person infiziert sich pro Woche.

https://swiss.social/@dominiksteiger/112457725063742400

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Die Tabelle gibt kumulative Inzidenzen basierend auf der Kalibrierung für Werdhölzli, sowie diejenigen basierend auf SentiSurv RLP und AMELAG.

Es ist seit Mitte Januar praktisch alles JN.1* (Pirola), mit mutmasslich dominantem Anteil an FLiRT-Derivaten und etwas KP.3*.

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Die Kalibration Werdhölzli ist unabhängig von SentiSurv RLP definiert, lief aber im Sommer 2023 parallel.

Ende März 2024 betrug die letzte Inzidenz SentiSurv RLP am 27.03. 244. Die Kalibration Werdhölzli vom 31.03. 300.

dominiksteiger,
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Quellen:

Neues Dashboard:
https://wise.ethz.ch

Weitere Quellen siehe Link.

Schönes Wochenende!

https://swiss.social/@dominiksteiger/112264182677401004

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State-of-the-art regarding masks and respirators. TLDR: They work. Especially respirators.

https://journals.asm.org/doi/10.1128/cmr.00124-23

Summary thread here: https://twitter.com/trishgreenhalgh/status/1793266317417439471

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AMELAG-Daten bis 15.5. zeigen erfreulicherweise auch wieder nach unten.

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Schätzung für Zürich aufgrund Kalibrierung der Abwasserprävalenzen Werdhölzli, Daten bis 12. Mai:

Inzidenz ~700.

Ca. jede 140. Person infiziert sich pro Woche.

Seitwärtsbewegung, wie letzte Woche bereits in Genf und Lugano, sowie in D.

https://swiss.social/@dominiksteiger/112423501422120854

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Die Tabelle gibt kumulative Inzidenzen basierend auf der Kalibrierung für Werdhölzli, sowie diejenigen basierend auf SentiSurv RLP und AMELAG.

Es ist seit Mitte Januar praktisch alles JN.1* (Pirola), mit mutmasslich steigendem Anteil an FLiRT-Derivaten und KP.3*.

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dominiksteiger,
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Die Kalibration Werdhölzli ist unabhängig von SentiSurv RLP definiert, lief aber im Sommer 2023 parallel.

Ende März 2024 betrug die letzte Inzidenz SentiSurv RLP am 27.03. 244. Die Kalibration Werdhölzli vom 31.03. 300.

Schönes Wochenende!

Quellen:
https://swiss.social/@dominiksteiger/112264182677401004

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Preprint: Excellent protection by the XBB.1.5 monovalent Covid vaccine in large Scandinavian cohort.

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.05.08.24307058v1

dominiksteiger,
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1.9 million matched pairs.

"This corresponded to 191.1 (95% confidence interval, 50.2 to 332.1) covid-19 hospital admissions and 109.2 (100.2 to 118.1) deaths prevented per 100,000 individuals vaccinated with an XBB.1.5-containing vaccine."

dominiksteiger,
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Complete shame for Switzerland, where national-level vaccination statistics are not even available.

How many 65+ were vaccinated with the XBB.1.5 monovalent vaccine in Switzerland?

How many hospitalisations and deaths were not prevented in Switzerland?

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Schätzung für Zürich aufgrund Kalibrierung der Abwasserprävalenzen Werdhölzli, Daten bis 5. Mai:

Inzidenz ~900.

Ca. jede 110. Person infiziert sich pro Woche.

Ansteigende Tendenz auch in D, A, F, UK.

https://swiss.social/@dominiksteiger/112378487334079647

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dominiksteiger,
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Die Tabelle gibt kumulative Inzidenzen basierend auf der Kalibrierung für Werdhölzli, sowie diejenigen basierend auf SentiSurv RLP und AMELAG.

Es ist seit Mitte Januar praktisch alles JN.1* (Pirola), mit mutmasslich steigendem Anteil an FLiRT-Derivaten und KP.3*.

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Die Dekonvolutionen aus dem Abwasser unterscheiden in CH im Moment leider keine JN.1*-Derivate.

Probensequenzierung in Europa:

Multilineage JN.1 Spike with S:R346T and S:F456L ("FLiRT"), 704 von 1'036 Seqs UK

Rechte Figur: KP.3, 130 von 153 Seqs UK

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Quellen: Siehe unten und Link.

Schönes Wochenende!

Collection 42: https://cov-spectrum.org/collections/42

https://swiss.social/@dominiksteiger/112264182677401004

dominiksteiger,
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Nachträge:

Die Kalibration Werdhölzli ist unabhängig von SentiSurv RLP definiert, lief aber im Sommer 2023 parallel.

Ende März 2024 betrug die letzte Inzidenz SentiSurv RLP am 27.03. 244. Die Kalibration Werdhölzli vom 31.03. 300.

dominiksteiger,
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Die Kalibration AMELAG ist gemäss Werten SentiSurv RLP Sommer 2023. Mit Faktoren 0.006 oder 0.008. Mit der neusten Version der Daten ist wohl 0.006 adäquater.

Bei den kumulativen Inzidenzen definiere ich ein neues lokales Minimum per Ende März 2024.

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My median is reached 4 weeks early. (Probably this is still incomplete registration)

Source: https://www.bfs.admin.ch/bfs/en/home/statistics/health/state-health/mortality-causes-death.html

https://swiss.social/@dominiksteiger/112020123684869094

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Data until week 19: The median distance to the FSO expectation of weekly mortality of the 65+ age group in 2024 is 102 fewer weekly deaths. Average is 113 fewer deaths.

https://swiss.social/@dominiksteiger/112020123684869094

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For what it's worth: At an estimated 30% FLiRT (JN.1* (Nextclade) + S:R346T, S:F456L) end of wk 10, the impoverished Singapore Covid monitoring shows reduced ARI levels and reduced SARS2 ARI specimen positivity, when comparing wks 9 and 10.

If the FLiRT subvariants have the capacity to drive Rt over 1, this trend would be expected to turn in the coming weeks.

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dominiksteiger,
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And perhaps the peak has been reached in wk 19. That would mean a considerably lower magnitude compared to last year's XBB wave.

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dominiksteiger,
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FLiRT sublineages are highly dominant; KP.3 seems not to play a role according to the covSPECTRUM data as of April 25.

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dominiksteiger,
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Interesting, the MOH itself is seeing a wave now. They even have case numbers. Did I overlook publication of these numbers?

https://www.news18.com/world/new-covid-19-wave-in-singapore-minister-advises-wearing-of-masks-after-25900-cases-recorded-in-a-week-8895361.html

dominiksteiger,
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According to their numbers, the wave might even have reached last spring wave height.

dominiksteiger,
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Here is their update. Would be nice if they wouldn't have ceased to publish data. Wastewater surveillance could also be considered, for such an advanced city-state.
https://www.moh.gov.sg/news-highlights/details/update-on-covid-19-situation

dominiksteiger,
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Covid wave in Singapore, update wk. 20: Highest SARS2 positivity among ARI since wk.9, 21%. I wonder if they are at peak yet.

No new seqs in covSPECTRUM since April 25. FLiRT highly dominant with the last data, KP.3 <10%.

Source:
https://www.moh.gov.sg/resources-statistics/infectious-disease-statistics/2024/weekly-infectious-diseases-bulletin

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Zwei Fragen zu Manuel Battegays Interview in der heutigen NZZ:

Erstens:

Wann waren die Spitaleintritte je "überwiegend mit und nicht wegen Covid"?

Ich sehe es in den Schweizer Daten nicht.

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dominiksteiger,
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Fallsterblichkeit nach Einweisung für Covid höher als für Grippe in der Saison 23/24 (Studie mit Daten aus der Datenbank des US Department of Veterans Affairs).

doi:10.1001/jama.2024.7395

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