Open letter to Nature editors complaining about the lack of code availability for AF3 (Publishing code is normally a prerequisite for publishing in Nature)
(Yes, I am fully aware of the irony of using a Google form to do this - not my idea, just sharing.)
En 2018, #AlphaFold, l’IA créée par #DeepMind, faisait une percée spectaculaire. [...] Une IA capable de prédire à quoi ressemblera une #protéine à partir de sa seule séquence. Sur les 200 millions de protéines connues, nous ne connaissons la structure 3D que de 20 % d'entre elles. Le #deeplearning fait donc cette promesse : combler ces lacunes pour de grandes avancées médicales et la création de nouveaux #médicaments
How accurately can one predict drug binding modes using AlphaFold models?
"the accuracy of ligand binding poses predicted by computational docking to AF2 models is not significantly higher than when docking to traditional homology models and is much lower than when docking to structures determined experimentally without these ligands bound."